L'écouvillon médical stérile ne contient pas de bactéries ou d'autres micro-organismes vivants. Les méthodes de stérilisation couramment utilisées comprennent l'autoclave, l'ETO (gaz d'oxyde d'éthylène) et le rayonnement gamma. Les écouvillons stériles sont généralement utilisés pour la collecte d'échantillons biologiques afin d'éviter la contamination des échantillons et à des fins médicales pour éviter les infections.